До 1957 г. наряду с командами мастеров в розыгрыше учавствовали и команды коллективов физкультуры. Одни розыгрышы сразу начинались с финальной части (с участием команд высшей лиги). В других, финальной части предшествовали прадварительные сореванования (с участием команд коллективов физкультуры и низших лиг).
Стадии, с которых стартовали команды высшей лиги, также менялись (чаще всего с 1/16 финала). Победители противоборствующих пар выявлялись как в одном матче с переигровкой, а позднее с помощью серии 11-метровых ударов в случае ничьей после дополнительного времени, так и по сумме 2 матчей.

Лишь финал всегда состоял из 1 матча и проводился в Москве (трижды - в 1965, 1971 и 1972 гг проводилась переигровка финала после ничейного результата первого финального матча).

Олимпийский принцип (проигравший выбывает из розыгрыша) оставался незыблимым, кроме 1979-82 гг, когда в финальной части розыгрыша вначале проводились зональные соревнования по круговой системе. В 1936-39 гг (в 1940-43 гг соревнования не состоялись), 1944-58 гг, 1961-65 гг, 1969-84 (лето) Кубок разыгрывался в течении одного сезона (весна-осень), 19-й и 25-27-й (отборочная часть) розыгрышы проходили в 2 года.

С осени 1984 г все розыгрышы организовывались по системе "осень-весна". 51-й розыгрыш кубка закончился весной 1992 г., уже после распада СССР, когда почти все команды бывших союзных республик снялись с соревнований. Поэтому его стали именовать Кубком СНГ. Победитель "Спартак" М получил почётный приз навечно. Кубок СССР предстовляет собой художественно выполненную хрустальную вазу в серебрянной оправе, высотой около 50 см. На крышке - бронзовая фигурка футболиста с мячом. на крышке и подставке выгравированы названия команд, выигравших Кубок.